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1 Linux系统简介和目录理解01

2024-06-27 来源:网络

  本视频深入讨论了Linux系统下的命令行操作和服务器配置管理。展示了如何在不同操作系统中访问Linux服务器,以及在服务器中进行用户登录、网络配置、文件操作等核心技能。主要内容包括Linux基础概念、文件和目录操作、软件安装方法、常用工具(AWK、Sed、grep)、正则表达式、脚本编写(bash)以及生物信息工具(blast、samtools等)的应用。介绍了Linux的优势,如稳定性、广泛的软件支持和强大的编程能力,并强调了目录结构、硬件配置查询等关键知识点。适合想要深入了解Linux操作系统、进行生物信息数据分析和服务器维护管理的技术人员。{{interaction.discussNum ? ( + interaction.discussNum + ) : }}{{ EROLE_NAME[item.user.identity] }}

  2009 年本科毕业于东北林业大学,2015 年硕博毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等,在Cell Stem Cell (封面文章),Nucleic Acids Research,Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇,累积引用 3000 +次;开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、EVenn、植物整合基因组平台IMP (获中华中医药学会 2023 年年度十大学术进展之一),使用超 70 万人次;运营有十四万人关注的微信公众号《生信宝典》,分享有1400 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频,阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊,ag真人平台官方现为执行主编,致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平综合性杂志。

  本视频讲解了使用Python进行图形绘制时如何调整参数以及图形之间的间距,特别是在Matplotlib库中创建共用X轴和Y轴的2x2图表的方法。重点介绍了调整直方图间距、颜色、透明度等参数的技巧;解释了如何使用循环来绘制多个图表以及如何调整线型和图例。内容也包括了对刻度的调整,着重讲了如何设置X轴和Y轴的刻度以及如何选择并调整图例的位置。适合对Python数据可视化有兴趣或需求的数据分析师、Python开发者和科研人员。

  本视频的核心内容围绕如何正确计算给定序列的GC含量。视频中展示了一个常见编程错误的解决过程,即忘记在每次循环结束时重置累加器导致数据计算错误。通过代码示例,讲解了如何在计算完成一个序列后清零,并注意到换行符可能导致长度计算偏差,显示了如何去除换行符以正确计算序列长度。此外,视频还涉及了如何进行数值的四舍五入以便获得更加精确的结果比对。视频内容对具备基础编程知译、对数据处理感兴趣、希望提高代码调试技巧以及有志于进行生物信息学数据分析的开发者都具有启发意义。

  视频讲解了使用Pandas库中不同函数进行矩阵合并的方法,以及处理合并过程中出现的数据缺失问题。提及了merge、concat和join三个函数的使用场景和它们在合并多个矩阵时的性能差异。介绍了合并后如何替换NA值为0以便于计算,并对结果矩阵进行了数据清洗,移除所有值为0的行。通过性能测试,讲解了如何优化矩阵合并步骤以减少运行时间。适合数据分析师、生物信息学家以及需要进行数据整理和分析优化的技术人员。

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